Em Atibaia, encontramos um dos remanescentes florestais de Mata Atlântica do Estado de São Paulo, a Serra do Itapetinga, que tem 13.000 hectares (130 milhões de m²). Em suas matas, já foram encontradas cerca de 130 espécies de árvores de um total de 415 espécies da flora.
Algumas árvores são muito vistosas, como é o caso do Ipê-amarelo que chama a atenção pelas suas flores, outras se mostram como gigantes da Serra, como o Paujacaré, Paineira, Copaíba, Angico, Cedro entre outros.
Espécies ameaçadas, como a Araucária, ainda sobrevivem na serra e são fonte de alimento para a fauna local. Há também espécies endêmicas de flores que dão um colorido especial à estrutura rochosa do local. No complexo de lajeados da Pedra Grande existem umas 105 espécies de plantas.
As espécies mais belas da flora são encontradas nos afloramentos rochosos. São orquídeas, bromélias, musgos, entre outros, dos quais cerca de 60 tipos são capazes de se estabelecer diretamente sobre a rocha. Nesse grupo, a espécie que chama mais atenção é a Amarílis. Quando ocorre a florada, desponta na rocha a Amarílis-vermelha, considerada um símbolo de Atibaia por ser a variação dessa flor encontrada na Pedra Grande.
É importante controlar a ação humana que já ameaça essa espécie, tão abundante no passado que, segundo relatos, era possível enxergar da cidade o tom avermelhado na Pedra Grande, na época da florada. Outras Amarílis são encontradas da Serra do Itapetinga, como a Amarílis-branca, que gosta de locais sombreados. A Tillandsia é outro gênero encontrado nos afloramentos da Serra do Itapetinga. São pequenas plantas de aparência rupestre que se afixam diretamente na rocha ajudando para a formação de novas “ilhas de solo”.
Outro endemismo marcante na Serra é a cactácea Rypsalis spinescens, citada pelo pesquisador Sérgio T. Meirelles em 1996. Tipicamente presente no afloramento da Pedra Grande, sua aparência discreta e afixação em pontos mais afastados dos locais tradicionais de visitação fazem com que a população passe despercebida, porém o mau uso da área poderá causar sua extinção.
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