A fauna de Cananeia está abrigado o mico-leão-de-cara-preta, espécie endêmica da Mata Atlântica, com sério risco de extinção.
Outros animais compõem o cenário paradisíaco da região, onde encontramos o jacaré-do-papo-amarelo, o bugio, o morcego, o mono-carvoeiro, a cuíca-d’água, o veado mateiro, a lontra, a paca, a cobra d’água, entre outros.
Já a fauna marinha está repleta de espécies muito conhecidas por nós, como: tainha, robalo, anchova, cação, sargento, linguado, namorado, garoupa, pescada, pargo e sardinha, além de baleia jubarte, golfinho-bico-de-garrafa, pinguim, tartaruga-cabeçuda, tartaruga-verde, tartaruga-de-pente, tartaruga-oliva, tartaruga-de-couro, águas-vivas, caravelas, ostras, camarões e caranguejos.
No caso dos pescados, é importante respeitar as épocas do defeso que cumpre seu papel na preservação das espécies marinhas, conservando-as para que esse espetáculo nunca acabe.
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